Saint-Florian est un haut lieu de la musique. Elle possède deux orgues, dont celui dit de Bruckner qui a plus de 7 000 tuyaux. Anton Bruckner en était le titulaire entre 1848 et 1855. Il était ancien petit chanteur de l'abbaye. Il est d'ailleurs enterré derrière l'orgue.
Ses petits chanteurs (Sankt Florianer Sängerknaben) sont célèbres dans toute l'Europe centrale et germanique. Leur fondation remonte à celle de l'abbaye, il y a mille ans ! Ils font des tournées internationales et reçoivent une éducation scolaire, spirituelle et musicale à Saint-Florian. Ils sont environ cinquante.