Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Actinopterygii (Actinoptérygiens, ou Poissons à nageoires rayonnées), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa). Les points qui font l'objet de débats au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés avant la bibliographie.
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
▲ └─o Actinopterygii ├─o Cladistii │ └─o Polypteriformes └─o Actinopteri └─o ├─o Chondrostei │ └─o Acipenseriformes └─o Neopterygii ├─o Ginglymodi │ └─o Lepisosteiformes └─o Halecostomi ├─o Halecomorpha │ └─o Amiiformes └─o └─o TELEOSTEI ►
 Polypterus weeksii (Polypteriformes) |  Esturgeon (Acipenser oxyrinchus oxyrinchus, Acipenseriformes, Acipenseridae) |  Amia calva (Amiiformes) |  Amia calva (Amiiformes |
 Baliste (Balistoides conspicillum, Teleostei, Tetraodontiformes, Balistidae) |
À la différence des Sarcoptérygiens, leur groupe-frère, tous les Actinoptérygiens sont des poissons ! En leur sein, la monophylie des Téléostéens n'est pas remise en question, mais les deux autres groupes classiques ont éclaté.
Les Chondrostéens ont perdu les Polyptériformes, qu'il a même été question de rapprocher des Sarcoptérygiens, mais cette hypothèse est aujourd'hui abandonnée ; les Polyptères semblent être simplement la groupe-frère de tous les autres Actinoptérygiens. Il n'y a par contre pas de consensus sur les Holostéens. Les premières analyses cladistiques les ont reconnus comme paraphylétiques (cf. cladogramme ci-dessus), mais ceci semble de moins en moins sûr (cf. G. Orti). Certains considèrent les Chondrostéens s.s. et les Holostéens comme formant un clade monophylétique, groupe-frère des Téléostéens.
On notera au passage que les Semionotiformes ne regroupent dans leur acception actuelle que des formes fossiles : les Lépisostéidés appartiennent désormais à un ordre à part.