André Gibert s'engage dans la Marine marchande en 1934 au rang d'élève officier. Dès 1935 il est lieutenant au long cours. Le 15 avril 1937, il incorpore l'Aéronautique navale pour y être breveté pilote le 19 octobre 1938. Il effectuera des missions principalement sur hydravion Latécoère 298 à l'escadrille T3 de septembre 1939 à septembre 1940 avec pour théâtres d'opérations le nord de la France et l'Italie. Il participera à la campagne de France avant d'être démobilisé. Ses faits d'armes lui vaudront sa première citation pendant cette campagne.
En février 1941, André Gibert embarque comme simple matelot sur un cargo mixte, pour le déserter à Saint-Thomas (Virgin Islands) afin de rejoindre l'Angleterre et le général de Gaulle, via New York, le Canada et une longue traversée de 25 jours de l'Atlantique Nord en convoi. Il est l'un des premiers pilotes à avoir rejoint le général Charles de Gaulle et la France libre. Il est engagé dès le premier avril 1941 dans les Forces navales françaises libres (FNFL). Après un passage en formation jusqu'au 10 novembre 1941 il participera à la création de la première escadrille française le Squadron 340 « Groupe de chasse Île-de-France » en tant que pilote de chasse sur Spitfire aux côtés de Philippe de Scitivaux, Maurice Choron, Bernard Dupérier, René Mouchotte, Laffont et d'autres. Il y restera de novembre 1941 à octobre 1942. Le 10 avril 1942, entre le Touquet et Boulogne-sur-Mer, une véritable bataille aérienne s'engage entre trois cents avions alliés et allemands; une des plus grosses rencontres aériennes de la guerre. Il participera également au débarquement de Dieppe le 19 août 1942.
André Gibert est ensuite envoyé aux États-Unis à Jacksonville en Floride commander la formation de la flottille 6FE, la première escadrille d'exploration des Forces navales françaises libres, sur hydravion PBY Catalina. À sa demande il retourne au combat aérien dès décembre 1943 dans le No. 611 Squadron RAF de la Royal Air Force sur Spitfire après avoir été affecté à Boscombe Down (Angleterre) comme pilote d'essai pour mettre au point le nouveau chasseur embarqué sur porte-avions le Blackburn Firebrand.
C'est la succession des missions sur la mer du Nord, la Manche, la Belgique, la Hollande. Il sera au-dessus de la France le 6 juin 1944, le jour du débarquement, et participera à la bataille de Normandie. D'octobre 1944 à février 1945, affecté à l'état-major Amiral Nord, il est officier de liaison à Paris. Il retournera à Jacksonville en Floride pour commander l'entraînement des pilotes de l'Aéronavale avant d'être démobilisé le 15 juillet 1946 avec le grade de capitaine de corvette. Il avait effectué 250 missions de guerre, avait deux victoires, était officier de la Légion d'honneur, croix de guerre 1939-1945 avec 8 citations et la médaille de l'Aéronautique lorsque qu'il rentre à Air France le 2 septembre 1946 en tant que pilote stagiaire.
Il sera commandant de bord dès le 1 octobre 1947, puis instructeur. Avec pour objectif d'améliorer la sécurité des vols commerciaux il sera co-fondateur en 1952 du Syndicat National des Pilotes de Ligne (SNPL) et en sera le président de 1953 à 1955. De 1960 à 1971, il est élu représentant du personnel navigant au conseil d'administration d'Air France qu'il a volontairement quitté en 1971.
André Gibert a pris sa retraite le 31 mars 1974 avec plus de 25 000 heures de vol.
