Placé sous la tutelle du Ministère de la Culture et de la Communication, il est administré par un conseil d’administration dont le président est nommé par le Ministre de tutelle.
Le directeur actuel est Géry Moutier. Il dirige le conservatoire avec à ses côtés un directeur-adjoint à compétence administrative. Il est assisté par ailleurs, d’un directeur des études musicales, d’un directeur des études chorégraphiques et d’un conseil d'orientation pédagogique.
L’équipe pédagogique est constituée de 180 professeurs, assistants et accompagnateurs. L’équipe administrative et technique regroupe 65 personnes. Les effectifs étudiants sont de 500 musiciens et 90 danseurs. Les étudiants étrangers représentent 15% des effectifs.
Une saison publique comporte près de 300 manifestations qui font partie intégrante du projet pédagogique, et permettent de mettre en valeur le talent et le travail des étudiants, professeurs et artistes invités.
Les partenariats du Conservatoire sont autant d’occasions de confronter les étudiants avec le milieu professionnel.
Le CNSMD de Lyon s’inscrit dans un réseau d’une cinquantaine d’établissements d’enseignement supérieur à travers les échanges Erasmus et multiplie aussi les projets avec des institutions hors Europe (en cours : Montréal, Bogota, Beyrouth).
Il bénéficie, pour ses projets et ceux des étudiants, des mécénats de la SACEM, de l'ADAMI, de la SPEDIDAM et de Mécénat Musical Société Générale et, pour ses actions à l’international, du soutien de la convention Cultures France, Région et DRAC Rhône-Alpes.
