Chez les tétrapodes, l'apparition des poumons (plutôt que des branchies) et des pattes (plutôt que des nageoires), s'est faite avant la sortie des eaux et la conquête terrestre, c'est-à-dire que l'adaptation de ces organes s'est faite initialement pour la vie en milieu aquatique :
- les poumons primitifs (sacs pulmonaires) des poissons pulmonés sont une adaptation première aux eaux pauvres des lagunes.
Ils ont été réutilisés (et améliorés) lors des premières sorties de l'eau.
- les pattes ayant un rôle de pagaies, avec des doigts pour agripper les proies lors d'une attaque.
La fonction marche des pattes permettant de sortir de l'eau et de conquérir la terre ferme est alors apparue plus tard, il s'agit donc d'une exaptation.
Chez les théropodes, l'apparition des plumes pour le vol semble de moins en moins être une adaptation directe pour le vol, mais plutôt une adaptation première à une meilleure régulation thermique durant la course, suivie d'une exaptation pour le vol.
En d'autre termes, cette lignée de dinosaures aurait développé d'abord un proto-plumage comme régulateur thermodynamique. De plus, ces plumes avaient probablement un rôle dans des parades sexuelles et de camouflage, comme chez les oiseaux actuels. Ces mêmes plumes auraient ensuite été réutilisées pour le vol, par sélection de leurs caractéristiques mécaniques.
Il en est sans doute de même, du système respiratoire des oiseaux, qui a dû connaitre d'abord une évolution parallèle chez ces dinosaures coureurs.
Chez les mammifères, le lait est probablement produit par des glandes sudoripares modifiées (les glandes mammaires). Une sorte de sueur devait suinter sur le corps des synapsides (ancêtres des mammifères) qui avaient développé des œufs à coquille molle et perméable, à l'inverse des sauropsides dont les oeufs sont calcifiés. A leur naissance, les jeunes se collaient à leur mère et étaient donc souvent en contact avec cette sécrétion aux propriétés protectrices et nutritives.
La transformation de cette « sueur » ou sécrétion spéciale en lait a pu se faire par plusieurs exaptations successives.
Chez l'homme moderne, le cerveau a pris sa forme finale durant la préhistoire (avant l'invention de l'écriture donc). Il apparait donc que l'aire de notre cerveau dédiée aujourd'hui à la lecture et à l'écriture (aire de Wernicke) s'est premièrement développée pour une raison autre (l'audition et le langage).
Elle a ensuite trouvé une seconde utilisation pour l'apprentissage de la lecture et de l'écriture, prolongeant ainsi ses fonctions premières.