Topographie
Longue d'environ six kilomètres pour deux kilomètres dans sa plus grande largeur, l'île de Croÿ a une superficie de 7 km². Son littoral est essentiellement constitué de falaises, seules quelques plages se trouvant sur sa partie sud-est.
Elle présente un relief escarpé et très peu de zones plates, sa ligne de crête occupant la majeure partie de l'île et culminant à 518 mètres. En outre, un grand lac occupant un cratère d'origine volcanique, le lac Claudine, se trouve dans le centre de l'île.
Climat
Son relief et la situation de Croÿ font que l'île présente une pluviosité et un brouillard encore plus important que dans le reste de l'archipel des Kerguelen. Comme la façade ouest de celui-ci, elle peut par ailleurs connaitre des vents extrêmement violents.
Faune et flore
Croÿ présente la particularité d'avoir une faune préservée : elle n'a connu aucune introduction d'espèces allogènes comme cela fut le cas sur la Grande Terre et d'autres îles des Kerguelen.