Saison 2
Dans l'épisode "Alliés", Michael, à bord de la ruche qui l’a recueilli, prend contact avec Atlantis afin d’utiliser le rétrovirus contre d’autres Wraiths, afin de les transformer en humains. Michael ne sait pas en revanche que la Reine Wraith a seulement l'intention d'utiliser Atlantis pour trouver un chemin d’accès vers la Terre. En fait, les autres Wraiths ne l’acceptent pas depuis sa transformation et dans l’épisode "Menace sur la Terre" en craignant pour sa vie, il aide John Sheppard à arrêter les vaisseaux ruches et sauver McKay et Ronon Dex.
Saison 3
Néanmoins, à la fin de l'épisode on lui donne de force une autre dose du rétrovirus. Michael et les autres Wraiths transformés sont déposés sur une planète de quarantaine dans "Transformation". Cependant, Michael a conservé ses mémoires de Wraith et provoque une révolte parmi les autres. On le croit tué quand l'expédition Atlantis bombarde son camp avec le vaisseau ruche volé dans l’épisode précédent.
Michael est retrouvé vivant dans l’épisode "L’Equilibre Parfait", ayant été sauvé par les Wraiths, mais de nouveau rejeté par sa race pour son infection "humaine". Aigri, il se met à construire son armée personnelle, mélangeant l’ADN de l’ectoparasite Wraiths avec celui des humains, créant ainsi une nouvelle créature mais détruisant plusieurs populations humaines dans le processus.
Saison 4
Un de ses laboratoires est détruit par l'équipe Atlantis, mais Michael s'échappe pour continuer son travail ailleurs. Dans le double épisode "Hydrides", Michel est déclaré responsable de la distribution du poison des Hoffans qui empoisonne les Wraiths à plusieurs mondes humains et pour l'enlèvement des Athosiens dans l’épisode "Seules contre tous" pour les utiliser dans ses expériences. Après avoir créé un clone de Carson Beckett, la partie finale de son plan consiste à enlever Teyla, dont l'enfant à naître est la clef du perfectionnement de sa race d'hybrides Humain-Wraith. Michael s'est soumis lui-même aux traitements et ne possède plus les organes Wraiths (il ne peut plus aspirer la force vitale, il peut se nourrir normalement).
Dans l'avenir alternatif de l’épisode "Le Dernier Homme (1/2)", Michael tue Teyla après qu'elle eut donné naissance, comme il n'avait plus besoin d’elle. Avec ses hybrides et le poison des Hoffans, il élimine les Wraiths en un an et se tourne ensuite vers la population humaine, convertissant les forts en hybrides et éliminant les faibles. Le McKay du futur change le cours des événements en renvoyant John Sheppard à son temps original, avec des informations sur l'emplacement de Teyla.
Saison 5
Cependant, quand Sheppard et son équipe vont enquêter, le bâtiment dans lequel ils sont s’effondre. Le piège alerte Michael de leur présence et il essaye de les capturer. Le Dédale arrive et engage le combat avec le croiseur Wraith, le détruisant après que l'équipe de Sheppard ait sauvé Teyla". L’Expédition Atlantis croit que Michael est mort, bien qu’elle soupçonne le contraire depuis qu’un Jumper est manquant".
Dans l’épisode "Le fils prodigue", Michael envahit Atlantis avec le Jumper occulté volé afin d'enlever le fils de Teyla et enclencher le système d'autodestruction de la cité. L'équipe réussit à détruire le Jumper, prenant au piège Michael dans la ville. Un combat s'ensuit entre Michael, Sheppard et Teyla sur la flèche centrale d'Atlantis, finissant par la mort de Michael.