Désorption-ionisation laser assistée par matrice - Définition

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Introduction

Spectromètre de masse MALDI-TOF

La désorption-ionisation laser assistée par matrice (en anglais Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation ou MALDI) est une technique d'ionisation douce utilisée en spectrométrie de masse, permettant l'analyse de biomolécules (des biopolymères comme les protéines, les peptides et les sucres) et les grosses molécules organiques (comme les polymères, les dendrimères et autres macromolécules) qui tendent à devenir fragiles et à se fragmenter lorsqu'elles sont ionisées par des méthodes plus conventionnelles. Elle est relativement similaire à l'ionisation par électrospray en douceur relative et en ions produits (bien qu'elle crée moins d'ions multichargés).

L'ionisation est provoquée par un faisceau laser (normalement un laser à l'azote). Une matrice est utilisée afin de protéger la biomolécule de la destruction par un faisceau direct et de faciliter la vaporisation et l'ionisation.

Matrice

Principe d'une source MALDI. L'échantillon (en vert) est co-cristallisé avec la matrice (en violet)

La matrice consiste en des molécules cristallisées, qui sont en général choisies parmi les trois suivantes : l’acide 3,5-diméthoxy-4-hydroxycinnamique (acide sinapique/acide sinapinique), l’acide α-cyano-4-hydroxycinnamique (alpha-cyano ou alpha-matrice) et l’acide 2,5-dihydroxybenzoïque (DHB). Une solution d'un type de ses molécules est faite, parfois dans un mélange d'eau ultra-pure et de solvant organique (habituellement de l'acétonitrile (ACN) ou de l'éthanol). L'acide trifluoroacétique (TFA) peut parfois être ajouté. Un bon exemple de solution-matrice est, par exemple, un mélange de 20 mg/ml d'acide sinapique dans l'ACN:eau:TFA (50:50:0,1).

La nature des composants pour une matrice fiable est déterminée par tâtonnement avec essais et erreurs, mais elle est basée sur des considérations spécifiques de « profils moléculaires ». Ses composants :

  • sont de faible masse moléculaire (afin de faciliter la vaporisation), mais assez grosses (avec une pression de vapeur assez grande) afin de ne pas s'évaporer durant la préparation de l'échantillon ou lors de son introduction dans le spectromètre.
  • sont acides, ou au moins agissant comme source de proton(s) afin de favoriser l'ionisation de l'analyte.
  • ont une forte absorption dans l'ultraviolet, leur permettant d'absorber efficacement et rapidement l'irradiation laser.
  • sont fonctionnalisés avec des groupes polaires, pour une utilisation en solutions aqueuses.

La solution matrice est mélangée avec l'analyte (l'échantillon). Le solvant organique permet aux molécules hydrophobes de se dissoudre dans la solution, alors que l'eau permet aux molécules hydrophiles de faire de même. La solution est ensuite déposée sur une coupelle MALDI (habituellement en métal conçue pour cet usage). Le solvant se vaporise, laissant seulement la matrice recristallisée, mais avec maintenant des molécules d'analyte réparties dans tout le cristal. La matrice et l'analyte sont dits alors co-cristallisés dans un spot MALDI.

Liste de composés utilisables comme matrice

Composé Abréviation Utilisation
Acide α-cyano-4-hydroxycinnamique HCCA Peptide (moins de 10kDa)
Hydrate de carbone
Acide sinapique SA Protéine (plus de 10kDa)
Dendrimers
Fullerenes
Acide 2-(4-hydroxyphénylazo)benzoïque HABA Protéine (plus de 10kDa)
Acide succinique - Peptide et protéine, Laser IR
Polymère synthétique, Laser IR
2,6-dihydroxyacétophénone - Peptide et protéine, Laser UV
Acide férulique - Peptide et protéine, Laser UV
Acide caféique - Peptide et protéine, Laser UV
Glycérol - Peptide et protéine, Matrice liquide
4-nitroaniline - Peptide et protéine, Matrice liquide
2,4,6-trihydroxyacétophénone THAP Oligonucléotide de moins de 3,5kDa
Hydrate de carbone acide
Acide 3-hydroxypicolinique HPA Oligonucléotide de plus de 3,5kDa
Acide anthranilique - Oligonucléotide de plus de 3,5kDa
Acide nicotinique - Oligonucléotide de plus de 3,5kDa
Acide trans-3-indoleacrylique IAA Polymère synthétique non polaire
Dithranol DIT Polymère synthétique non polaire
Lipide
Dendrimers
Acide 2,5-Dihydroxybenzoïque DHB Polymère synthétique polaire
Molécule organique
Hydrate de carbone
Isovanilline - Molécule organique
3-aminoquinoline - Hydrate de carbone
T-2-(3-(4-t-butyl-phényl)-2-méthyl-2-propénylidène)malononitrile DCTB Molécule inorganique
1-isoquinolinol - Oligosaccharide
Acide picolinique - Oligonucléotide
2,5-dihydroxyacétophénone DHAP Protéine (plus de 10kDa)
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