Ligase - Définition

Introduction

En biochimie, une ligase est une enzyme qui catalyse la jonction de deux molécules (en anglais ligation) par de nouvelles liaisons covalentes avec hydrolyse concomitante de l'ATP ou d'autres molécules similaires.

Nomenclature

le nom courant des enzymes de type ligase incluent souvent le terme « ligase » comme par exemple l'ADN ligase du phage T4. utilisée pour suturer des fragments d'ADN. D'autres noms courants utilises le mot « synthétase », car ces enzyme catalysent la synthèse de nouvelle molécules.

Attention cependant à ne pas confondre les enzymes synthétases avec les enzymes synthases qui sont des enzymes du groupe des lyases, et qui contrairement aux synthétases n'utilisent pas l'énergie libérée par la déphopsphorylation des nucléotides triphosphatés (comme l'ATP, la GTP, la CTP, la TTP et l'UTP).

Classification

Les ligases sont classées EC 6 dans la nomenclature EC des enzymes. Cette classe peut ensuite être divisée en six sous-classes :

• EC 6.1 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-oxygène
• EC 6.2 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-soufre
• EC 6.3 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-azote
• EC 6.4 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-carbone
• EC 6.5 : regroupe les ligases qui forment des liaisons ester phosphorique
• EC 6.6 : regroupe les ligases qui forment des liaisons azote-métal