L'aéroport de Colmar a été créé par les troupes alliées à la fin de la Seconde guerre mondiale. Le terrain militaire, désaffecté, est acquis par la Ville de Colmar, puis ouvert à la Circulation Aérienne Publique (CAP) en 1953 et affecté à cette époque aux seuls besoins de l'aviation légère et sportive. En 1962, début des vols réguliers de la compagnie Air Alsace qui fonctionnera sur Colmar-Houssen jusqu'en 1982, essentiellement avec des avions bi-turbopropulseurs de type Nord 262 et Fokker 27.
En 2000, le terrain a été menacé de fermeture. Mais, devant l'opposition des acteurs concernés et le monde socio-économique, plusieurs conventions de gestion ont été mises en place. D'abord, la Ville de Colmar et la Chambre de commerce et d'industrie de Colmar et du Centre-Alsace puis la Société d'Exploitation de l'Aéroport de Colmar (SEAC) et depuis le 1er Janvier 2007, la Société de l'Aéroport de Colmar - ADC est devenue gestionnaire.
En 2008, après un long immobilisme, l'aéroport autorise enfin les ULM, avec restriction (appareils locaux uniquement), deux écoles de pilotage ULM 3 axes sont implantées sur place.