À ses missions de création et de transmission du savoir dans les champs des géosciences s’ajoute une mission d’observation des phénomènes naturels en volcanologie, sismologie et géomagnétisme. La surveillance des trois volcans actifs français, la Soufrière, la montagne Pelée et le Piton de la Fournaise, est assurée par l'institut.
L'institut collabore à plusieurs projets de recherche industrielle, tels que les missions martiennes au travers de la conception de la caméra chimique Chemcam qui équipe le rover MSL de la NASA en 2009, et du sismomètre de la mission Exomars, planifiée pour 2013, ou le stockage géologique du dioxyde de carbone en collaboration avec Total et Schlumberger.
L'IPGPE propose un master professionnel en génie de l'environnement ou génie de subsurface, un master recherche en géophysique, géochimie ou géologie, cohabilité avec l'école normale supérieure de la rue d'Ulm. L'institut possède également une école doctorale des Sciences de la Terre en collaboration avec l'université Paris VII et l'école normal supérieure.
En 2010, l'établissement compte quatorze équipe de recherche.