Depuis 2003, Hoffman écrit sur l'effondrement du World Trade Center (WTC) et sur d'autres aspects des attentats du 11 septembre dans lesquels, pense-t-il, est impliqué le gouvernement des États-Unis. Il est co-auteur, avec Don Paul, de Waking up from our Nightmare: The 9/11 Crimes in New York City et d'une vidéo sortie en février 2006 : 9/11 Guilt: The Proof is in Your Hands.
Il a aussi donné des conférences et a été interviewé dans des émissions de radios aux États-Unis et au Canada. Il s'est en particulier intéressé à l'effondrement du WTC 7, et a été critique envers l'explication officielle donnée. Hoffman a aussi écrit une critique sur le rapport officiel du NIST concernant les effondrements, une critique de la FAQ du même organisme, et des critiques sur des articles de revues de vulgarisation scientifique comme Scientific American et Popular Mechanics ayant pour objet les théories non-officielles. L'éditeur de Popular Mechanics, James B. Meigs, décrit Hoffman comme un « leader des théories du complot ».
Dr. Steven E. Jones, un physicien, anciennement de la Brigham Young University, a crédité le site web WTC7.net de Hoffman et son travail de source d'inspiration pour mener ses propres analyses sur les effondrements des tours du WTC. Le livre d'Hoffman et ses sites webs sont cités dans l'essai de Jones Why Indeed Did the WTC Buildings Collapse? Il l'est également par David Ray Griffin..
Hoffman a été très critique sur ce qu'il considère comme les théories conspirationnistes les plus extrêmes. Il n'appuie pas, en particulier, la théorie qui veut que le Pentagone ait été frappé par autre chose qu'un avion, et son site web contient une critique très précise des documentaires Loose Change et 911 Mysteries.