L’église
Les travaux ont commencé à la fin du XII siècle, et se sont poursuivis durant les premières décennies du siècle suivant.
Elle est pourvue d'une abside d'un roman très pur, faisant face à une nef de transition entre le roman et le gothique, dont la croisée d'ogives reste primitive. Quatre grandes statues d'évangélistes ornent la croisée du transept.
A la Renaissance a été ajouté le « coro alto ». La coupole sur trompes a été refaite, et se caractérise par sa proche parenté avec celles des cathédrales de Salamanque et de Zamora.
La façade, comme la plupart des bâtiments conventuels a été reconstruite, au XVII siècle.
La statue de Santa María la Real, du XII siècle, recouverte d'argent, et le reliquaire plateresque de San Veremundo, abbé d'Irache, ne sont plus là : ils ont été transférés en l'église de Dicastillo, au sud d'Estella, après la loi de desamortización (confiscation des biens de l'Église).
Le cloître
Le cloître fut édifié entre 1540 et 1586.
Il s'agit d'un des meilleurs exemples du style plateresque, selon les plans de Martín de Oyarzábal, tant par son plan que par l'ornementation sculpturale, dans laquelle alternent des scènes religieuses et mythologiques. Il est décoré de culs-de-lampe et de chapiteaux qui relatent la vie du Christ et de saint Benoît.
De la première époque appartient le portail appelé "Especiosa" (1547), et qui met en communication l'église avec le cloître.