Ce germe exclusivement humain est l'agent de la blennorragie. C'était, il y a quelques années, la plus fréquente des maladies vénériennes mais, actuellement, c'est l'infection à chlamydia trachomatis.
C'est la très grande fragilité de ce germe vis-à-vis de la dessiccation, de l'oxydation et des rayons lumineux qui explique la transmission exclusivement par contact direct des muqueuses chaudes et humides où il végète.
Chez l'homme, après une incubation de 3 à 5 jours, apparaît une uréthrite antérieure aiguë, purulente ("chaude-pisse"). En l'absence de traitement, l'uréthrite devient chronique et peut se compliquer de prostatite, d'épididymite.
Chez la femme, l'infection est beaucoup plus discrète (75 % des cas passent inapercus): uréthrite, bartholinite, cervicite, parfois rectite, pouvant se compliquer en salpingite plus grave parce que menant à la stérilité. La salpingite est favorisée par la présence d'un stérilet (corps étranger !).
Dans les deux sexes, 1 % des cas environ peut se compliquer d'une bactériémie dont la plus fréquente localisation secondaire est l'arthrite (mono-arthrite).
Chez le nouveau-né, contaminé lors de l'accouchement (par voie basse), peut survenir entre le 1er et le 5ème jour une atteinte oculaire bilatérale très grave: l'atteinte commence par une conjonctivite purulente qui entraîne rapidement des ulcérations de la cornée pouvant mener à la cécité.