Les travaux de Zdenek et al. (2007) sur la phylogénie du clade (Phengaris+Maculinea) ont permis d'identifier l'ancien genre Maculinea comme un groupe à l'intérieur de Phengaris. Toutefois, ces études ne permettent toujours pas de placer Phengaris au sein d'une sous-famille particulière et se retrouve donc Incertae sedis. La liste des espèces comprend donc l'ensemble des espèces des deux genres, c'est-à-dire :
- de Maculinea :
- Phengaris alcon (Denis et Schiffermüller, 1775) — Azuré des mouillères ou protée ;
- Phengaris arion (Linnaeus, 1758) — Azuré du serpolet ;
- Phengaris arionides (Staudinger, 1887) ;
- Phengaris cyanecula (Eversmann, 1848) ;
- Phengaris kurentzovi Sibatani, Saigusa et Hirowatari, 1994 ;
- Phengaris ligurica Wagner, 1904 ;
- Phengaris nausithous (Bergsträsser, 1779) — Azuré des paluds ;
- Phengaris ogumae (Matsumura, 1910) ;
- Phengaris rebeli (Hirschke, 1904) — Azuré de la croisette ;
- Phengaris teleius (Bergsträsser, 1779) — Azuré de la sanguisorbe.
- de Phengaris :
- Phengaris albida Leech, 1893 ;
- Phengaris atroguttata (Oberthür, 1876) ;
- Phengaris daitozana Wileman, 1911.