Le refuge d'oiseau de l'Île aux Basques est situé sur le fleuve Saint-Laurent en face de la ville de Trois-Pistoles. Le refuge est situé dans les territoires des municipalités de Notre-Dame-des-Neiges et Saint-Simon, tous deux étant située dans la municipalité régionale de comté des Basques, dans la région du Bas-Saint-Laurent.
Le refuge protège trois îles, soit l'île aux Basques, La Razade d'en Haut et La Razade d'en Bas, ainsi qu'une bande de 500 m les entourant. Il a un territoire de 8,53 km, la partie terrestre couvrent 0 78 km et la partie marine couvrant 7,75 km.
Le refuge a été reconnu comme zone importante pour la conservation des oiseaux. La portion terrestre du refuge d'oiseaux chevauche la réserve naturelle de l'Île-aux-Basques-et-des-Razades.