Cette espèce est classée par l'IUCN en LC (Préoccupation mineure).
Initialement classé dans le genre Emberiza, puis transféré dans un genre distinct Miliaria Brehm, 1831 à cause de sa taille plus grande que les autres bruants, et à un dimorphisme sexuel peu important du point de vue du plumage. Cependant, les analyses de squelettes, puis les analyses d'ADN mitochondrial, ont montré le manque de justifications pour une classification dans un genre différent.
Le Bruant proyer est donc désormais nommé Emberiza calandra, et admet pour synonymes latins Miliaria calandra Linné, Emberiza miliaria Linné, Fringilla projer Muller et Miliaria europaea Swainson.
On reconnait 4 sous-espèces :
On peut aussi rencontrer E. c. insularis Parrot.