Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Dinoflagellata lato sensu (Dinozoa, Dinozoaires, Dinoflagellés), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa). Les points qui font l'objet de débats au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés avant la bibliographie.
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
▲ └─o Dinozoa ou Dinoflagellata s.l. ├─o Perkinsea ├─? Ellobiopsidae └─o Dinoflagellata s.s. ├─? Oxyrrhinaceae └─o ├─o Syndiniophyceae └─o Dinokaryota ├─o Gymnodiniphycidae └─o ├─o │ ├─o Prorocentrales │ └─o Dinophysiphycidae ├─o Gonyaulacales └─o Peridiniales
▲ └─o Dinozoa ou Dinoflagellata s.l. ├─o Perkinsea ├─? Ellobiopsidae └─o Dinoflagellata s.s. ├─? Oxyrrhinaceae └─o ├─o Syndiniophyceae │ ├─? Duboscquellaceae │ └─o Syndiniales │ ├─o Syndiniaceae │ ├─o Amoebophryaceae │ ├─? Coccidiniaceae │ ├─? Spiromonadaceae │ └─o Sphaeriparaceae └─o Dinokaryota ├─o Gymnodiniphycidae │ ├─o Suessiales │ │ ├─o Suessiaceae │ │ └─o Symbiodiniaceae │ └─o │ ├─o groupe Borghiella │ ├─o Tovelliaceae │ ├─o groupe haptophore │ ├─o Ptychodiscales │ │ ├─o Amphitholaceae │ │ ├─o Brachydiniaceae │ │ └─o Ptychodiscaceae │ └─o Gymnodiniineae │ ├─o Gyrodinium │ └─o │ ├─o Gymnodiniaceae │ ├─o Polykrikaceae │ ├─o Warnowiaceae │ ├─? Actiniscineae │ │ ├─o Actiniscaceae │ │ └─o Dicroerismaceae │ └─? Noctilucales │ ├─o Noctilucaceae │ ├─o Leptodiscaceae │ └─o Kofoidiniaceae └─o ├─o │ ├─o Prorocentrales ou Prorocentraceae │ └─o Dinophysiphycidae │ ├─o Nannoceratopsiales ou Nannoceratopsiaceae │ └─o Dinophysiales │ ├─o Oxyphysiaceae │ ├─o Dinophysiaceae │ └─o Amphisoleniaceae ├─o Gonyaulacales │ ├─o Cladopyxiineae │ │ ├─o Cladopyxiaceae │ │ ├─o Lotharingiaceae │ │ ├─o Mancodiniaceae │ │ ├─o Pareodiniaceae │ │ └─o Scriniocassiaceae │ └─o Gonyaulacineae │ ├─o Gonyaulacaceae │ ├─o Ceratocoryaceae │ ├─o Ceratiaceae │ └─o Goniodomaceae │ ├─? Goniodomoideae │ ├─? Gambierdiscoideae │ └─o │ ├─o Pyrodinioideae │ ├─o Helgolandinioideae │ └─o Pyrocystaceae └─o Peridiniales ├─o Heterocapsineae ou Heterocapsaceae └─o ├─o Glenodiniineae ou Glenodiniaceae └─o Peridiniineae ├─o Podolampaceae ├─o Protoperidiniaceae │ ├─o Protoperidinioideae │ ├─o Diplopsaloideae │ └─o Lessardioideae └─o Peridiniaceae ├─o Peridinium ├─o groupe diatomophore ├─o Peridiniopsideae ├─o Blastodinium └─o ├─o groupe Pfiesteria └─o groupe Calciodinellum