L'église San Zaccaria est une édifice religieux de Venise en Italie situé dans le Sestiere de Castello, non loin de la place Saint-Marc.
La première église qui datait IXe siècle, fut construit sous le 11e doge, Giustiniano Participazio, afin y abriter les restes de Zacharie, le père de Jean le Baptiste. Huit doges furent enterrés dans la crypte romane.
L'édifice reconstruit en 1170 (le campanile date de cette époque), fut de nouveau rebâtie au XIVe siècle. Elle fut ensuite rattachée à un monastère bénédictin et le doge s'y rendait chaque année à Pâques, visite durant laquelle une cérémonie consistait à lui présenter le bonnet dogal, le corno ducale (ou « Zoïa »). Cette tradition viendrait du fait que les moines avaient fait don d'un terrain à la Sérénissime au XIIe siècle afin que l'on y bâtisse une extension du palais des doges.
L'édifice actuel a été construit entre 1444 et 1515, dans un style mêlant le Gothique et le style Renaissance. Le premier des architectes fut Antonio Gambello à qui l'on doit l'essentiel du bâtiment. Seule la façade est de Mauro Codussi.
L'intérieur possède une abside entourée d'un déambulatoire éclairé par de hautes fenêtres gothiques, une caractéristique typique de l'architecture des églises du Nord de l'Europe qui est unique à Venise. Les murs des couloirs sont entièrement recouverts de peintures du Tintoret, d'Angelo Trevisani, de Giuseppe Porta, de Giovanni Bellini, d'Antonio Balestra, de Tiepolo, de Palma le Vieux et de Van Dyck. Le sculpteur Alessandro Vittoria est également enterré dans l'église, son tombeau est orné de son buste auto-portrait.
La plus fameuse peinture de l'église, une Conversation sacrée de Giovanni Bellini | L'église sur un tableau de Francesco Guardi exposé au Louvre |