Le toponyme île de la Conférence apparaît sous la forme Isola della Pace en 1690 sur la carte de Cantelli.
Avant les événements de 1659 qui la firent entrer dans la postérité, l'île s'appelait Insura Haundia ('la grande île' en basque).
Jean de La Fontaine a fait une allusion malicieuse à la rencontre de 1660 dans sa fable des « Deux Chèvres » :
Je m'imagine voir, avec Louis le Grand,
Philippe Quatre qui s'avance
dans l'île de la Conférence.