L’Université Masaryk (en tchèque : Masarykova universita) de Brno est le second établissement de l'enseignement supérieur tchèque par le nombre des étudiants qui y étudient (après l’Université Charles de Prague). Créé par la loi du 10 janvier 1919, elle est nommée en l'honneur de Tomáš Masaryk, professeur à l'Université Charles et premier président de la Tchécoslovaquie.
L'université participe aux échanges inter-universitaires européens du réseau d'Utrecht et du Groupe de Compostelle.