Les Circaètes recherchent de préférence de grands arbres dans des endroits peu fréquentés, plutôt en lisière qu'au milieu d'une dense forêt.
Le nid est souvent petit comparativement aux autres rapaces de même envergure ; il est habituellement situé en retrait du tronc, sur une grosse branche latérale, ou en position sommitale de l'arbre, car, du fait de leur envergure, les Circaètes ont besoin de place pour atterrir au nid.
La ponte est toujours constituée d'un seul œuf, pondu entre fin mars et courant avril, avec parfois une ponte de remplacement en mai en cas d'échec de la première tentative (météo, dérangement, prédation,...).
En secteur montagneux, le nid est souvent situé à flanc de falaise ou dans le versant d'une combe (peut-être pour faciliter l'envol de l'aiglon). Dans les régions plus plates (forêts d'Ukraine, Landes de la Gironde, pentes des collines de Judée, etc.), l'emplacement du nid semble plutôt dicté par la tranquillité de la zone.
La couvaison dure environ 45 jours.
La durée d'élevage est très longue, puisque l'envol de l'aiglon n'a lieu que deux mois et demi après l'éclosion, soit début août en Europe.