D'après la classification de référence (version 2.5, 2010) du Congrès ornithologique international (ordre phylogénique) :
- Lonchura cucullata – Capucin nonnette
- Lonchura bicolor – Capucin bicolore
- Lonchura nigriceps – Capucin à dos brun
- Lonchura fringilloides – Capucin pie
- Lonchura striata – Capucin domino
- Lonchura leucogastroides – Capucin javanais
- Lonchura fuscans – Capucin sombre
- Lonchura molucca – Capucin jacobin
- Lonchura punctulata – Capucin damier
- Lonchura kelaarti – Capucin à ventre roux
- Lonchura leucogastra – Capucin à ventre blanc
- Lonchura tristissima – Capucin à tête rayée
- Lonchura leucosticta – Capucin tacheté
- Lonchura quinticolor – Capucin coloré
- Lonchura malacca – Capucin à dos marron
- Lonchura atricapilla – Capucin à tête noire
- Lonchura maja – Capucin à tête blanche
- Lonchura pallida – Capucin pâle
- Lonchura grandis – Grand Capucin (oiseau)
- Lonchura vana – Capucin des Arfak
- Lonchura caniceps – Capucin gris
- Lonchura nevermanni – Capucin de Nevermann
- Lonchura spectabilis – Capucin à capuchon
- Lonchura forbesi – Capucin de Nouvelle-Irlande
- Lonchura hunsteini – Capucin de Hunstein
- Lonchura flaviprymna – Capucin à croupion jaune
- Lonchura castaneothorax – Capucin donacole
- Lonchura stygia – Capucin noir
- Lonchura teerinki – Capucin à poitrine noire
- Lonchura monticola – Capucin des montagnes
- Lonchura montana – Capucin des Maoke
- Lonchura melaena – Capucin de Nouvelle-Bretagne
- Lonchura fuscata – Padda de Timor
- Lonchura oryzivora – Padda de Java
