La première version sortie pour Half-Life est une application à part entière, lancée en arrière-plan en même temps que le jeu. Depuis 2001, le programme est directement intégré au moteur de jeu.
Lors d'une partie, le PunkBuster du serveur peut communiquer avec le PunkBuster du client, et ainsi vérifier si le client se conforme aux règles communes. Dans le cas où le serveur détecte une anomalie, il bannit temporairement ou définitivement le joueur suspect, en bannissant le numéro de série du jeu ainsi que plusieurs numéros de série de pièces détachés de son ordinateur, afin que le "tricheur" ne puisse plus jouer en ligne aux jeux PunkBuster.
Voici les moyens dont PunkBuster met en place et dispose :
- Il recherche en temps réel des programmes de triches connus dans la mémoire vive des clients, en utilisant une base de données.
- Le système de mise à jour en arrière plan s'assure qu'aucune nouvelle version corrompue ou fausse ne soit installée sur la machine client par le biais de multiples serveurs sur Internet.
- Des rapports d'erreurs cryptés sont fréquemment envoyés au serveur par les clients.
- Les administrateurs du serveur peuvent manuellement bannir un joueur.
- Le serveur peut optionnellement être configuré pour rechercher des joueurs exploitant des bogues du moteur de jeu.
- Le serveur peut également être configuré pour vérifier l'authenticité des fichiers de base du jeu, par des fonctions de hachage MD5.
- Les administrateurs du serveur peuvent voir des captures d'écran des clients, cela peut permettre de détecter une triche éventuelle.
- Certains noms de joueurs insultants peuvent être prohibés.
- Le serveur peut donner des privilèges d'administrateurs à certains joueurs, lorsqu'aucun administrateur n'est présent dans une partie.
- Il est possible aux administrateurs de contrôler le serveur par le protocole HTTP sans être présent dans une partie.
- Les administrateurs peuvent publier les journaux de bord du serveur. Quelques organisations telles que PunksBusted, PBBans et AASA utilisent ces fichiers pour créer et maintenir des listes de tricheurs.
Grâce aux mises à jours fréquentes et automatiques, PunkBuster reçoit les descriptions des programmes de triche et les repère presque aussitôt qu'ils sont découverts.
Il est théoriquement possible de créer un programme, utilisant le protocole de PunkBuster, qui enverrait de faux rapports ne montrant pas la présence de programmes interdits. En pratique, les mises à jours très fréquentes dissuadent, et ne laissent pas le temps aux hackers de trouver des failles. Les listes de tricheurs dissuadent également les joueurs tentés.