Fondée en novembre 1993, elle commença à voler l'année suivante en 1994. Elle est présidée depuis 1997 par Akbar Al Baker, son PDG actuel. De seulement 4 avions en 1997, elle passe à 28 à la fin de 2003, 50 en 2006 et d'ici 2013, elle devrait atteindre les 110 avions dans sa flotte. En juin 2007, elle annonce au Salon international de l'aéronautique et de l'espace de Paris-Le Bourget la plus grande commande d'Airbus A350, soit 80 ainsi que de 3 Airbus A380 additionnels. Lors du Salon aéronautique de Dubaï de novembre 2007, Qatar Airways commande 60 Boeing 787 Dreamliner ainsi que de 32 Boeing 777. Le 26 novembre 2004, Qatar Airways inaugure sa nouvelle route aérienne entre Doha et Pékin, devenant la première compagnie du Moyen-Orient à desservir la capitale chinoise. Début 2005, Qatar Airways desservait 56 destinations. Le 2 décembre 2005, Qatar Airways inaugure sa nouvelle route aérienne entre Doha et Madrid. Le 11 septembre 2006, Qatar Airways reçoit son premier Airbus A340-600. Elle commence à desservir l'Amérique du Nord pour la première fois avec des vols quotidiens en juin 2007 vers New York à l'aéroport international Newark Liberty et un mois plus tard en juillet 2007 vers Washington, DC à l'aéroport international de Washington-Dulles. Le 27 novembre 2007, Qatar Airways inaugure sa nouvelle route aérienne entre Doha et Stockholm, devenant la première compagnie aérienne du Moyen-Orient à desservir la Scandinavie. En octobre 2008, Qatar Airways transfère ses vols à l'aéroport international John-F.-Kennedy de New York . Le 30 mars 2009, Qatar Airways inaugure sa nouvelle route aérienne quotidienne entre Doha et Houston, faisant ainsi sa troisième entrée aux États-Unis. En mai 2009, Qatar Airways annonce qu'elle va lancer d'ici dix mois des vols quotidiens vers Sydney et Melbourne en Australie, Amritsar et Goa en Inde ainsi que deux autres villes européennes. Le 15 juin 2009, Qatar Airways annonce l'achat de 24 Airbus A320 lors du Salon international de l'aéronautique et de l'espace de Paris-Le Bourget.