Système nerveux central
Communs
Sur 2,081 sujets, somnolence (12.5%), maux de tête (3.8%), étourdissements (3.8%), nervosité (2.7%), dépression (2.5%), troubles de la mémoire (2.3%), vision double (2.2%), agressivité (2.0%), ataxie (1.9%), vertige (1.9%), hyperactivité (1.8%), anomalies visuelles (1.6%), confusion (1.4%), insomnie (1.3%), trouble de la concentration (1.2%), troubles de la personnalité (1.1%). Sur 299 enfants, 33 (11%) sont devenus hyperactifs.
Rares
Quelques patients développent une psychose pendant la durée de la thérapie, ce qui est plus commun chez les adultes que les enfants. Même chez les patients n'ayant jamais eu d'épisode de psychose avant la thérapie. D'autres effets secondaires rare sont l'anxiété, humeur labile, irritabilité, tremblements, démarche anormale et trouble de la parole.
Gastro-intestinale
Communs
Douleur abdominale (1.6%), constipation (1.4%), vomissements (1.4%) et nausées (1.4%).
Rares
Dyspepsie et augmentation de l'appétit chez moins de 1% des sujets de tests en clinique.
Le corps
Commun
Fatigue (9.2%), gain de poids (5.0%), asthénie (1.1%).
Tératogénicité
Une étude tératologique conduite sur des lapins à découvert qu'une dose de 150 mg·kg·j était la cause d'une fissure palatine chez 2% des petits et une dose de 200 mg·kg·j l'amenait chez 9%. Ceci pourrait provenir d'une baisse du niveau de méthionine, selon une étude publiée en mars 2001. En 2005, une étude réalisée Université de Catania a été publiée et mentionne que les rats dont la mère a consommé de 250–1 000 mg·kg·j avaient une performance plus faible dans le labyrinthe d'eau et les taches en terrain ouvert, ceux du groupe de 750 mg étaient de faible poids à la naissance et n'ont pas rattrapé le groupe de contrôle et ceux du groupe de 1 000 mg n'ont pas survécu à la grossesse.
Il n'y a pas eu de contrôle tératologique sur l'humain à ce jour.
À propos des anomalies visuelles
En 2003, il a été démontré par Frisén et Malmgren que le vigabatrine causait une atrophie diffuse irréversible de la fibre nerveuse rétinienne dans une étude rétrospective de 25 patients. Cette effet est plus prononcé sur la partie externe (à l'opposé de la macula, ou partie centrale) de la rétine.