Les Chytridiomycètes s.l. s'avèrent être le grade primitif, paraphylétique, des Champignons. En leur sein, les Blastocladiales s.l. sont peut-être plus proches parents des Zygomycètes que des Chytridiomycètes proprement dits. Parmi ces derniers, les Spizellomycètes eux-mêmes se sont avérés polyphylétiques, et les Olpidiacés en ont été retirés, Rozella étant peut-être plus proche des Microsporidies, Olpidium des Basidiobolales, etc.