IDEE est créée, avec le but d'être le relais de l'UDF dans les facultés, a la mi-2004. Toutefois, suite a des dissensions entre la direction de IDEE et l'UDF, le mouvement IDEE devient , au bout de quelques semaines, indépendant de l'UDF, malgré les tentatives de la nouvelle direction de IDEE (jusqu'à la mi-2007) de rapprocher IDEE a l'UDF.
Juillet 2007 : Scission de l'association après le départ des sections locales de Caen, Montpellier, Lyon 2 et 3 pour rejoindre la Confédération étudiante lors de son congrès national.*
Des structures ont toutefois décidé de maintenir l'organisation, ce sont les sections locales de Versailles, Paris 1 et 2.