Au printemps 2003, la Lower Manhattan Development Corporation (LMDC), syndicat responsable de l'aménagement et du développement du bas Manhattan, a lancé une compétition internationale pour la construction d'un mémorial sur le site du World Trade Center afin de commémorer les vies perdues lors des attentats du 11 septembre 2001. Au total, 5 201 projets furent déposés par des équipes américaines et du monde entier.
Le 19 novembre 2003, le jury composé de treize membres, dont Maya Lin, l'architecte du Vietnam Veterans Memorial, et Patricia Harris, première adjointe au maire, a sélectionné huit projets pour un examen final. Le projet Reflecting Absence (littéralement, le "reflet de l'absence") a finalement été choisi comme grand vainqueur du concours d'architecture, le 6 janvier 2004. Le projet final pour le Mémorial du World Trade Center a été officiellement présenté lors d'une conférence de presse, le 14 janvier 2004, au Hall Fédéral de New York.
Les travaux ont débuté le 13 mars 2006 à 8h, heure locale. Le même jour, des proches de victimes et d'autres citoyens concernés se sont réunis pour protester contre le nouveau mémorial qui, selon eux, devrait plutôt être construit à la surface. Le président de la Fondation du Mémorial rétorqua que les familles avaient été consultées, qu'un consensus s'était formé autour du projet choisi et que, par conséquent, les travaux devaient se poursuivre comme prévu.
En mai 2006, l'information selon laquelle les coûts de construction avaient été revus à la hausse au-delà du milliard de dollars a été rendue publique.
"Le maire, Michael Bloomberg, a annoncé que le coût de construction du mémorial du 11 septembre montait en flèche et qu'il devait être limité à 500 millions de dollars. 'On ne peut tout simplement pas dépenser des sommes illimitées juste pour un mémorial', a annoncé Bloomberg. 'N'importe quel chiffre supérieur à 500 millions serait "inapproprié", même si cela nécessite de retravailler le projet.' "
Avec un milliard de dollars, le budget approcherait le coût de la construction initiale du World Trade Center en 1970, à dollar constant.
Bien que le mémorial ait initialement reçu un accueil positif, il a eu son lot de critiques jugeant le projet trop cher, trop compliqué et à l'esthétique intenable. Parmi les problèmes :