Simplified Molecular Input Line Entry Specification - Définition

Extensions

SMILES Isomérique

Il existe des extensions du langage SMILES permettant de décrire la chiralité et la conformation des doubles liaisons. On peut ainsi décrire la conformation R ou S d'un carbone asymétrique ou l'isomérie cis/trans. On peut également décrire les états de protonation, la présence d'isotopes spécifiques et même décrire des schémas réactionnels.

SMARTS

SMARTS est une extension de SMILES qui permet, en plus des définitions classiques, de remplacer des atomes ou des liaisons par des jokers. Ceci est utilisé pour spécifier des motifs chimiques utilisés pour des recherches dans des banques de données de molécules (chimiothèques). Cela permet en particulier la recherche de sous-structures chimiques communes à deux molécules.