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Entrez

Introduction

Le système global de recherches inter-bases de données Entrez (en anglais Entrez Global Query Cross-Database Search System) permet d'accéder à des bases de données du site internet du National Center for Biotechnology Information (NCBI). Le NCBI fait partie de la National Library of Medicine (NLM), qui est elle-même un département des National Institutes of Health (NIH) du gouvernement des États-Unis.

Genbank

Article principal : GenBank

Bases de Données

Entrez (Le système global de recherches inter-bases de données Entrez (en anglais Entrez Global Query Cross-Database Search System) permet d'accéder à des bases de données...) permet de faire une recherche (La recherche scientifique désigne en premier lieu l’ensemble des actions entreprises en vue de produire et de développer les connaissances scientifiques. Par extension métonymique, la recherche...) globale ou filtrée dans les bases de données suivantes:

  • All Databases: recherche dans toutes les bases de donnée ci dessous
  • NCBI web site: NCBI web and FTP web sites
  • PubMed: litterature scientifique (Un scientifique est une personne qui se consacre à l'étude d'une science ou des sciences et qui se consacre à l'étude d'un domaine avec la rigueur et les méthodes scientifiques.) et biomédicale avec le plus souvent accès aux résumés (abstracts). La consultation de l'article intégral est également possible pour certains journaux lorsqu'un lien a été établi avec l'éditeur.
  • Protein: recherche de séquences
  • Nucleotide: recherche de séquences (GenBank)
  • EST: Expressed Sequence Tags database
  • GSS: Genome Survey Sequences Database
  • Structure: structures macromoléculaires en 3D
  • Genome: séquences complètes Mapping
  • BioSystem": voies métaboliques
  • Books: livres en ligne
  • CancerChromosomes: aberrations cytogénétique des cancers
  • Conserved domains: domaine conservés des protéines
  • 3D Domains: domaines en 3D
  • Genes: genes
  • Genome Project: informations issues du human genome project
  • dbGAP: genotypes et phenotypes (database of Genotypes and Phenotypes)
  • GENSAT: atlas d'expression de genes du systeme nerveux central de souris (Le terme souris est un nom vernaculaire ambigu qui peut désigner, pour les francophones, avant tout l’espèce commune Mus musculus, connue aussi comme animal de compagnie ou de laboratoire, mais aussi de nombreuses...)
  • GEO Profiles: profil d'expression de genes
  • HomoloGene: groupes eukariotes homologues
  • Journals: titres et caractéristiques des journaux médicaux et scientifiques
  • MeSH: Catalogue des mots clés
  • NLM Catalog: données bibliographiques de la librairie Nationale de Médecine américaine (NLM)
  • OMIM: transmission mendelienne chez l'homme (Un homme est un individu de sexe masculin adulte de l'espèce appelée Homme moderne (Homo sapiens) ou plus simplement « Homme ». Par distinction, l'homme prépubère est appelé un garçon, tandis...)
  • OMIA: transmission mendelienne chez l'animal (Un animal (du latin animus, esprit, ou principe vital) est, selon la classification classique, un être vivant hétérotrophe, c’est-à-dire qu’il se nourrit de substances organiques. On réserve...)
  • Peptidome: données d'identification de peptides et de protéines par spectrographie de masse (Le terme masse est utilisé pour désigner deux grandeurs attachées à un corps : l'une quantifie l'inertie du corps (la masse inerte) et l'autre la contribution du corps à la force...) en tandem
  • PMC: Pubmed Central, sous ensemble (En théorie des ensembles, un ensemble désigne intuitivement une collection d’objets (les éléments de l'ensemble), « une multitude qui peut être...) de Pubmed ne comportant l'intégralité des articles accessibles librement
  • PopSet: données sur l'étude des populations (epidemiologie)
  • Probe: séquences spécifiques
  • Protein cluster:
  • PubChem BioAssay: bioactivité des substances chimiques
  • PubChem Compound: activité biologique et structure chimique de composés uniques
  • PubChem Substance: activité biologique et structure chimique de composés complexes
  • SNP: polymorphismes nucleotidiques simples
  • SRA: données issues du séquençage de dernière génération (Short Read Archive (SRA))
  • Taxonomy: organismes dans GenBank Taxonomie
  • UniGene: groupe de séquence transcrite issues d'un même gène
  • UniSTS: séquences uniques de l'ADN dont la localisation est la position sont connues
Source: Wikipédia publiée sous licence CC-BY-SA 3.0. Vous pouvez soumettre une modification à cette définition sur cette page.

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