- Agromyza apfrlbecki Strobl Mouche mineuse de l'Artichaut
- Agromyza lathyri Hendel Mouche noire mineuse des Légumineuses
- Amauromyza chamaebalani (Hering) Petite mouche mineuse des Légumineuses
- Amaromyza flavifrons (Meigen) Mouche mineuse en plaque des Chenopodiaceae
- Calycomyza humeralis (von Roser) Mouche mineuse en plaque des Composées
- Chromatomyia horticola (Goureau) Mouche mineuse horticole
- Chromatomyla syngenesiae Hardy Mouche mineuse polyphage
- Liriomyza brassicae (Riley) Mouche mineuse des Crucifères
- Liriomyza bryoniae (Kaltenbach) Mouche mineuse de la Bryone
- Liriomyza cepae (Hering) Mouche mineuse des Liliaceae
- Lîriomyza chinensis(Kato) Mouche mineuse chinoise
- Liriomyza congesta (Beeker) Mouche mineuse des Légumineuses
- Liriomyza huidobrensis Spencer Mouche mineuse sud américaine
- Liriomyza nietzkei Spencer Mouche mineuse des Liliaceae
- Liriomyza trifolii (Burgess) Mouche mineuse serpentine américaine
- Napomyza carotae Spencer Mouche mineuse de la Carotte
- Napomyza cichoili Spencer Mouche mineuse de l'Endive
- Napomyza gymnostoma (Loew) Mouche mineuse des Liliaceae.
- Ophiomyia asparagi Spencer Mouche mineuse de l'Asperge
- Ophiomyia pinguis (Fallén) Mouche grise de l'Endive
- Ophiomyia simplex (Loew) Mouche mineuse de l'Asperge
- Phytomyza ftrulae Hering Mouche mineuse des feuilles de Carotte
- Phytomyza penicilla Hendel Mouche mineuse de la Laitue
- Phytomyza rufipes Meigen Mouche mineuse des Brassicaceae
- Ptochomyza asparagi Hering Petite mouche mineuse de l'Asperge
Les 2 espèces Liriomyza brassicae et Liriomyza cepae ne sont pas recensées de France mais elles sont signalées de pays limitrophes.
Les Agromyzidae sont tous phytophages au stade larvaire, comme les Tephritidae. Les larves espèces appartenant aux genres Liriomyza ou Chromatomyia sont extrêmement polyphages.
Ces insectes sont très importants sur le plan agronomique par les dégâts directs qu'ils occasionnent, particulièrement sur des jeunes plantes, la feuille pouvant, par exemple, être complètement minée. Par leurs piqûres nutritionnelles les femelles de certaines espèces sont capables d'inoculer des champignons pathogènes, ou de transmettre des virus.
Environ 10 % des espèces d'Agromyzidae peuvent être considérés comme des ravageurs. Les genres les plus importants sont Agromyza, Melanagromyza, Ophiomyia, Liriomyza, Napomyza, Chromatomyia et Phytomyza.
En France, 25 espèces peuvent être retenues comme des ravageurs sérieux ou potentiels de nos cultures maraîchères, selon les espèces leur importance agronomique et très variable.