Chromosome X

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Introduction

Le chromosome X humain

Le chromosome X est l'un des deux chromosomes sexuels de l'être humain et de certains animaux (l'autre chromosome sexuel est le chromosome Y). Il fait partie du système XY de détermination sexuelle.

Caractéristiques du chromosome X

  • Nombre de paires de base : 154 824 264

  • Nombre de gènes : 931

  • Nombre de gènes connus : 766

  • Nombre de pseudo gènes : 380

  • Nombre de variations des nucléotides (S.N.P ou single nucleotide polymorphisme) : 320 997

  • L'image ci dessous illustre la richesse génétique du chromosome X à comparer avec le chromosome Y. La zone en vert localise le centre de l'inactivation de l'X.

Chromosome X Etude Inactivation X.PNG

Inactivation du chromosome X ou lyonisation

Les hommes ont un seul chromosome X et les femmes deux chromosomes X. Ce chromosome X n'aboutit pas à une « surproduction » des protéines codées par ce chromosome. Par exemple, les facteurs de coagulations comme le facteur VIII est codé par le chromosome X. Les femmes ne possédent pas pour autant deux fois plus de facteur VIII.

Il existe donc une inactivation de l'un des deux chromosomes qui prend une forme condensée et visible, le corpuscule de Barr ou corps de Barr. Ce "corpuscule" se situe généralement dans le noyau de la cellule, sous la membrane interne de l'enveloppe nucléaire.

Le processus d’inactivation est aléatoire, se faisant au stade précoce du blastocyste, et se transmet d'une génération cellulaire à l'autre. La moitié des cellules de la femme sont sous la dépendance du chromosome X paternel et l'autre moitié sous la dépendance du chromosome X maternel. Les tissus somatiques féminins sont des mosaïques génétiques.

Ce processus d’inactivation a été soupçonné par Mary Lyon en 1961 et est aussi parfois appelé lyonisation.

Pour comprendre certains mécanismes, il est important de savoir que le chromosome X est inactivé par un centre d'inactivation (site du chromosome X):

Quand celui-ci sera inactivé, des enzymes vont aller sur le centre d'inactivation et se propager le long du chromosomes pour inactiver la plupart des gènes.

Par conséquent, si un des deux chromosomes X subit une translocation avec, par exemple, le chromosome 21 alors, dans les cellules où le chromosomes X inactivé est celui touché par la translocation, une partie du chromosome 21 sera inactivé tandis qu'une autre partie du chromosome X ne le sera pas.

Anomalies chromosomiques décrites au niveau du chromosome X

  • Syndrome de Klinefelter :
  • Syndrome triple X (également appelé 47,XXX ou trisomie X)
  • Syndrome de Turner

Gènes localisés sur le chromosome X

De nombreux gènes situés sur le chromosome X sont en cause dans des retards mentaux, ce qui pourrait expliquer, entre autres, qu'il y ait davantage de garçons porteurs d'un handicap mental que de filles. Plus d'infos sur https://www.xtraordinaire.org , le site du handicap mental lié au chromosome X (RMLX ou XLMR, pour X linked mental retardation).

gênenomlocusNom des syndromes associés
Retards mentaux syndromiques
FMR1Xq27.3Syndrome de l’X fragile (site FRAXA)
ARXXp22.1Syndrome de Partington, syndrome XLAG (X-linked lissencephaly with abnormal genitalia) ou syndrome de Berry-Kravis, Syndrome de Proud, Spasmes infantiles liés à l’X (syndrome de West )
MECP2Xq28Syndrome de Rett, PPM-X (psychosis,pyramidal signs, macroorchidism), Retard mental avec spasticité (Meloni)
CDKL5STK9Xp22Syndrome de Rett variant, Crises partielles précoces +/- Spasmes infantiles (syndrome de West ) ISSX
PQBP1Xp11.23Renpenning syndrome, Sutherland syndrome, Golabi-Ito-Hall syndrome
XNPXq13.3Syndrome ATR-X (alpha thalassémie RM lié à l’X)Syndrome de Juberg-Marsidi, Syndrome de Chudley-Lowry,Syndrome de Smith-Fineman-Myers, Syndrome de Carpenter-Waziri, Syndrome de Holmes-Gang, ,Syndrome de Martinez
JARID1C/ SMCXXp11.22microcéphalie
DCXXq23Syndrome SCLH (subcortical laminar heterotopia), XLIS
OPHN1Xq12Retard mental lié à l’X avec hypoplasie cérébelleuse
PHF8Xp11.22Syndrome de Siderius-Hamel
PHF6Sd de Börjesson, Forssman, Lehmann
Gènes causant un RM non syndromique (pour le moment)
FMR2X fragile site FRAXE (RM non spécifique léger)
GDI1
AGTR2
ZNF41, ZNF 81, ZNF 674Gènes des zinc finger protéines
ILIRAPL1Interleukine 1 receptor accesory proteine like 1 ;
TM4SF2/TSPAN7 tetraspanine 7
DLG3
FTSJ1
FACL4
PAK3
MECP2
SLC6A8Xq28Déficit en transporteur de la créatine
Tous les autres…

Source: Pr des Portes - Déc 2006

Maladies localisées sur le chromosome X

  • La nomenclature utilisée pour localiser un gène est décrite dans l'article de celui-ci
  • Les maladies en rapport avec des anomalies génétiques localisées sur le chromosome X sont :
Maladies localisées sur le chromosome X
PathologieTransmissionO.M.I.MLocusGèneProtéine codée par le gène
Bras long
Dysplasie fronto-métaphysaireQ28
Syndrome oto-palato-digital type I et type IIQ28
Syndrome de Melnick-NeedlesQ28
Hétérotopie nodulaire héréditaire liée à l' XQ28
Dystrophie musculaire d'Emery-DreifussQ28
Adrénoleucodystrophie liée à l'XQ28
Syndrome CHILDQ28
Hydrocéphalie liée à l'XQ28
Syndrome M.A.S.AQ28
Paraplégie spastique familiale de type 1Q28
Syndrome de RettQ28
Hémophilie ARécessive à l'XQ28
DaltonismeQ28
Myopathie congénitale myotubulaireRécessive à l'X310400q28MTM1
Syndrome de l'X fragileQ27.3
Hémophilie AQ27
Syndrome de Borjeson-Forssman-LehmannQ26.3
Syndrome de LoweQ26.1
Syndrome de Lesch-NyhanQ26
Q26
Maladie lymphoproliférative liée à l'XQ25
Q25
Q23.1
Q23
Albinisme oculaire lié à l'XQ22.3
Syndrome d'AlportQ22.3
Maladie de FabryQ22
Maladie de Pelizaeus-MerzbacherQ22
Paraplégie spastique familiale type 2Q22
Syndrome de Mohr-TranebjaergQ22
Agammaglobulinémie liée au sexeRécessive liée à l'X300300q21.3-q22BTK
Myopathie de DuchenneQ21.2
Q21
Syndrome de la corne occipitaleQ13.3
Maladie de MenkèsQ13.3
Anémie sidéroblastique liée à l'X avec ataxieRécessive liée à l'X301310q13.1-q13.3ABCB7
Dystonie avec parkinsonisme liée à l'XQ13.1
Maladie de Charcot-Marie-Tooth lié à l'XQ13
Thalassémie alpha liée à l'X avec retard mentalQ13
Q13
Q12
Pseudohermaphrodisme masculin par insensibilité aux androgènesQ11
Maladie de KennedyQ11
Bras court
p11
Chondrodystrophie calcifiante congénitale
Syndrome d'Aarskogp11.21
Syndrome de Cornelia de Lange300590p11.21SMC1L1
Syndrome Homme XXP11.3
Syndrome oculo-facio-cardio-dentaireP11.4
Syndrome de McLeodRécessive314850P21.1XK
Déficit en Glycérol Kinasep21.3-p21.2Glycerol Kinase
Hypoplasie Congénitale des Surrénalesp21.3-p21.2Géne DAX-1
Syndrome d'AicardiP22
Syndrome d’Opitz lié à l’X
Syndrome de Coffin-LowryP22.1

Les autres chromosomes

Chromosome - Chromosome humain
Autosomes
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