Chaque sérotype ou souche contient de nombreuses sous-souches. Par exemple , chez le type 1, on compte entre-autres les souches Mahoney (isolée en 1941), MEF2, Brunhilde (isolée en 1939) et Frederick ; chez le type 2, les souches Lansing (isolée en 1938), MEF1 , Wilfred et YSK ; chez le type 3, la souche Leon (isolée en 1937).
Le Type 1 regroupe 80 % des souches , le type 2 et 3 représentant chacun 10 %. La souche Mahoney est très virulente. De plus, elle a pour caractéristique de causer une paralysie aux singes après une injection musculaire (ce que ne produisent pas toutes les autres souches). Enfin cette paralysie est provoquée même après de très fortes dilutions de la souche. Injectée en intramusculaire, la souche Mahoney a 10 000 fois plus de chances que les autres souches d'entrer dans la circulation sanguine et de gagner la moelle osseuse.
Le poliovirus serait de tous les virus à ARN l'un des plus mutagènes, bien plus encore que le virus de la grippe.