Antibiogramme - Définition

L'utilisation de l'antibiogramme au quotidien

L'antibiogramme est un outil validé par un biologiste médical qui permet au médecin de choisir le bon antibiotique, ou l'association d'antibiotiques permettant de traiter efficacement un patient. Cependant, la plupart du temps, il n'est pas nécessaire car beaucoup d'infections sont traitées efficacement de façon probabiliste. On fait une hypothèse sur l'antibiotique et la bactérie à traiter en fonction du lieu de l'infection (amygdale, abdomen, poumon...) car ce sont souvent les mêmes espèces qu'on trouve aux mêmes endroits. Un antibiogramme est fait dans les cas d'infections graves (choc septique, infections nosocomiales...) ou lorsque les antibiotiques choisis en probabiliste ne fonctionnent pas. Cette attitude aboutit à l'utilisation répétée des mêmes antibiotiques et contribue à l'émergence de souches résistantes.

Du prélèvement à l'antibiogramme

On recueille les bactéries :

• dans le sang. Elles sont ensuite mises en culture (hémoculture).
• dans les urines,
• dans les selles, les excréments,
• dans les crachats, les lavages broncho-alvéolaires (on lave à l'eau les bronches pendant une fibroscopie et on analyse ce liquide de lavage),
• dans le liquide céphalo-rachidien, dans lequel baigne le cerveau, le tronc cérébral, le cervelet et la moelle épinière,
• ...

Les bactéries sont mises en culture et ensuite identifiées (on détermine si c'est un Staphylocoque, un Streptocoque etc.). Ensuite, c'est le biologiste qui décide s'il est nécessaire de réaliser un antibiogramme.

La réalisation pratique de l'antibiogramme

• L'antibiogramme est souvent automatisé. Les bactéries sont déposées en suspension (dans un liquide) dans un récipient, puis la machine aspire ce liquide et le dépose sur une carte (format carte de crédit) dans laquelle il y a de petites zones correspondant à chaque antibiotique. La machine lit ensuite cette carte et donne automatiquement les résultats (sensible, intermédiaire, résistant).
• Parfois, on peut refaire un antibiogramme pour certains antibiotiques choisis par le biologiste. Soit on réalise la procédure décrite en 1. Soit on utilise d'autres techniques plus onéreuses, mais plus simples comme le E-test. On ensemence une boîte de Petri, puis on dépose une bande E-test qui comprend un gradient d'antibiotique croissant d'une extrémité à l'autre (pas d'antibiotique à gauche, concentration maximale à droite) et ces concentrations d'antibiotiques sont écrites directement sur cette bande. On met en incubation la boîte et on lit la CMI à l'intersection du disque d'inhibition avec la bande.

un E-test

Interprétation de l'antibiogramme

• L'antibiogramme n'est pas rendu tel quel. Une interprétation des données brutes est nécessaire.
• Les résistances des bactéries ne s'expriment pas toujours. Il est donc important de connaître les résistances naturelles.
• Certaines résistances sont hétérogènes et ne vont toucher qu'une partie des souches. Dans ce cas, il est parfois nécessaire de travailler dans des conditions qui favorisent l'expression de la résistance.
• L'étude des mécanismes de résistance permet d'établir des profils de résistance.
• L'antibiogramme est également un bon outil d'orientation pour certaines souches difficiles à identifier.

NB: Les différents disque d'antibiotiques utilisés pour réaliser l'antibiogramme en phase solide sur gélose portent des abréviations, dont voici la liste: AM Ampicilline AMC Amoxicilline + Ac. Clavulanique AMX Amoxicilline AN Amikacine ATM Aztreonam C Chloramphénicol CAZ Ceftazidime CD02 Ceftazidime + Ac. Clavulanique 02 CD03 Ceftazidime + Ac. Clavulanique 03 CF Céfalotine CIP Ciprofloxacine CPO Cefpirome CS Colistine CTX Céfotaxime CXM Céfuroxime E Erythromycine FA Acide Fusidique FEP Céfépime FOS Fosfomycine FOX Céfoxitine FT Nitrofurane-furane GEN Gentamicine 500 GM Gentamicine 500 IMP Imipénème K Kanamycine KAN Kanamycine 1000 L Lincomycine LVX Lévofloxacine MA Céfamandol MOX Moxalactame - Latamoxef MXF Moxifloxacine N Néomycine NA Acide Nalidixique NOR Norfloxacine OFX Ofloxacine OX Oxacilline P Pénicilline PEF Péfloxacine PIP Pipéracilline PT Pristinamycine RA Rifampicine SPX Sprafloxacine SXT Cotrimoxazol-Triméthoprime + Sulfaméthoxazol TCC Ticarcilline + Ac. Clavulanique TE Tétracycline TEC Teicoplanine TIC Ticarciline TM Tobramycine TZP Pipéracilline + Tazobactam - Tazocilline VA Vancomymcine