Les premiers Mk.IF servirent comme chasseurs de nuit et lorsque les Allemands stoppèrent les raids sur Londres, le Squadron 615 avait obtenu cinquante victoires dont treize pour John Cunningham et son observateur Jimmy Rawnsley. Ils servirent également comme chasseur diurne à long rayon d'action. Par la suite, en Europe, les versions suivantes des « Beau » se distinguèrent dans les attaques de navires par torpillages et à l'aide de roquettes.
Les Beaufighter restèrent en service en première ligne dans la RAF jusqu'en 1950.
Le Beaufighter arriva dans les Squadrons en Asie et dans le Pacifique courant 1942.
Dans le Théatre de l'Asie du Sud Est, le Beaufighter Mk.VIF opérant depuis l'Inde pour des missions de nuit contre les lignes de communications japonaises en Birmanie et en Thaïlande. La grande vitesse et la basse altitude des attaques furent hautement efficaces, et ceci malgré le temps souvent exécrable. Les soldats Japonais le baptisèrent Whispering Death (la mort chuchotante).
Avant l’arrivée des DAP Beaufighter (de conception australienne) aux Squadrons de la RAAF (Royal Australian Air Force), Le Bristol Beaufighter Mk.IC fût employé pour des missions anti-navire. La plus connue de celles-ci est la bataille de la mer de Bismarck dans la quelle ils opérèrent avec les Douglas A-20 et B-25 Mitchell de l’USAAF.
Fin 1944, les unités de Beaufighter de la RAF furent engagées dans la guerre civile grecque et se retirèrent finalement en 1946. Le Beaufighter fut aussi utilisé par le Portugal, la Turquie ainsi que la République dominicaine. Il fut aussi brièvement utilisé par l’Armée de l'air israélienne.