L’information est un principe fondamental de la stratégie. En conséquence, le SI est également un outil essentiel dans la stratégie d'entreprise. D’une part, elle permet aux employés de l’organisation de mettre en œuvre les décisions de la direction générale. D'autre part, les systèmes d’information permettent de définir une politique propre à l’entreprise (ex : e-commerce).
Certains systèmes de nature différente ont ainsi fait leur apparition afin de permettre à l’organisation d’acquérir un avantage concurrentiel. Ce phénomène s’illustre par une domination par les coûts, une différenciation ou une stratégie de niche. Pour ce qui est de la stratégie de domination par les coûts l'urbanisation, du système d'information constitue un outil de réingénierie pouvant permettre d'atteindre une lean IT plus efficiente. De plus, les SI peuvent être utiles aux décideurs dans le processus de conception et de choix de la stratégie à mettre en place grâce à la récolte et au traitement des informations ayant un caractère décisionnel. Cependant traditionnellement le système d'information réalise un alignement stratégique avec la stratégie globale de l'entreprise.
Le SI est lui-même composé de matériels et logiciels ayant des conséquences dans le management des organisations. En effet, l’infrastructure technologique du système d’information est un ensemble de dispositifs pouvant provoquer des changements organisationnels dans une entreprise. Ces outils sont reliés par des réseaux informatiques permettant à l’information de circuler rapidement dans l’entreprise. De plus, des entrepôts de données permettent de collecter et structurer les différentes informations dans le but de piloter l’activité.
Le Progiciel de Gestion Intégré a pour effet de faciliter la fluidité des processus organisationnels et de simplifier la gestion des infrastructures. Alors que certaines applications ont une vocation interne à l’entreprise (Gestion de la chaîne logistique), d’autres sont davantage tournées à l’extérieur (Gestion de la relation client).
L'informatique décisionnelle a pour principal objectif d’assister les managers. C’est un enjeu essentiel depuis les débuts des systèmes d’information qui peut s’expliquer par l’importance de l’information dans la prise de décision. Les SIAD (système interactif d’aide à la décision) aident à la préparation et au choix de la décision grâce à des dispositifs permettant l’accès aux données et à des tests de validité. Les dirigeants devront prendre des décisions stratégiques grâce aux informations dites Business Intelligence et au management des systèmes d’information.