Matese n'a pas souhaité donner de nom à cet astre hypothétique, cependant elle déclara que la désignation « Planète X » n'était pas séduisante. Perséphone vient de la mythologie grecque, où elle incarne la femme de Pluton. Certains appellent aussi cette planète du nom de Proserpine, déesse des romains.
Dans les nombreux articles y faisant références, les principales nominations sont quand même Planète X, dixième planète ou encore la planète au-delà de Pluton.
Le site « Solstation », la nomme aussi Sol B en référence à un Soleil bis, si sa masse était celle d'une naine brune.