Les facteurs gouvernants les réactions organiques sont à peu près les mêmes que pour n'importe quelle autre réaction chimique. Les facteurs spécifiques sont ceux qui déterminent la stabilité des réactifs et des produits, comme la conjugaison, l'hyperconjugaison ou l'aromaticité, ainsi que l'existence et la stabilité des intermédiaires réactionnels, comme les radicaux, les carbocations et les carbanions.
Un composé organique peut posséder de nombreux isomères. La sélectivité en terme de régiosélectivité, diastéréosélectivité et énantiosélectivité est un critère important pour la classification de nombreuses réactions organiques. La stéréochimie des réactions péricycliques est gouvernée par les règles de Woodward-Hoffmann et celle de nombreuses réactions d'élimination par les règles de Zaïtsev.
Les réactions organiques sont importantes pour la production de produits pharmaceutiques. Une étude de 2006 estime que 20 % des réactions provoquées dans ce but impliquent des alkylations sur des atomes d'azote ou d'oxygène, que 20 % consistent en des protections/déprotections, 11 % en la formation de nouvelles liaisons carbone carbone et 10 % dans des conversions de groupes fonctionnels.
En chimie des hétérocycles, les réactions organiques sont classées selon le type d'hétérocycle formé : taille de cycle et type d'hétéroatome (voir les indoles).
Les réactions organiques peuvent aussi être classées selon le type de liaison élément-carbone. On distingue par exemple les chimies des organosilicium, des organophosphore ou des organosoufre, et celle des organométalliques quand la liaison est de type carbone-métal.
Une réaction organique peut être classée selon le type de groupe fonctionnel qu'elle implique ou qui se forme à son issue. Par exemple, pour le réarrangement de Fries, le réactif est un ester et le produit de réaction un alcool. Voici un aperçu des groupes fonctionnels avec leur obtention et leur réactivité :
groupe fonctionnel | préparation | réactions |
---|---|---|
Acides carboxyliques | préparation | réactions |
Acyloïnes | préparation | réactions |
Alcools | préparation | réactions |
Aldéhydes | préparation | réactions |
Alcanes | préparation | réactions |
Alcènes | préparation | réactions |
Alcynes | préparation | réactions |
Amides | préparation | réactions |
Amines | préparation | réactions |
Anhydride d'acide | préparation | réactions |
Aziridines | préparation | réactions |
Azotures | préparation | réactions |
Cétones | préparation | réactions |
Cyclopropanes | préparation | réactions |
Diazo | préparation | réactions |
Diols | préparation | réactions |
Esters | préparation | réactions |
Éthers | préparation | réactions |
Époxyde | préparation | réactions |
Halogénocétones | préparation | réactions |
Halogénure d'acyle | préparation | réactions |
Halogénure d'alkyle | préparation | réactions |
Hydrocarbures aromatiques | préparation | réactions |
Imines | préparation | réactions |
Isocyanates | préparation | réactions |
Lactames | préparation | réctions |
Nitriles | préparation | réactions |
Nitro | préparation | réactions |
Nitrite d'alkyle | préparation | réactions |
Oxyde d'amine | préparation | reactions |
Phénol | préparation | reactions |
Thiols | préparation | réactions |