Les populations de Spheniscidae sont globalement en déclins même si les populations de gorfou de Schlegel ou de Gorfou des Snares se maintiennent. En 2008, selon les estimations de l'IUCN, trois espèces sont en danger (EN) : le Gorfou de Sclater, le Manchot des Galápagos, le Manchot antipode, l'estimation sur les deux premières pouvant évoluée vers le statuts de danger critique d'extinction. Sept espèces sont considérées comme vulnérables, deux comme quasi-menacées, et cinq comme en préoccupation mineur. Deux sont inscrites sur la liste I de la CITES, le Manchot de Humboldt et le Manchot du Cap, toutes deux vulnérables selon l'IUCN.
D'après la classification de référence du Congrès ornithologique international (ordre phylogénique) :
D'après la classification de référence du Congrès ornithologique international (ordre phylogénique) :