10 avions de pré-série (Ar 232A-01 à -10) prirent l’air entre les 1er février et 17 juillet 1943, sans qu’il soit possible d’identifier avec certitude le second prototype. Une seule chose est certaine : Les cinq premiers partirent directement au front. Le A-01 gagna en effet Stalingrad dès le 6 février 1943, les essais en vol officiels ne débutant en fait que le 29 avril 1943 avec l’avion A-05. Durant ces essais, qui comprirent des vols avec chargement de matériel vers Kirowograd, deux appareils furent perdus, le A-07 (23 juillet 1943) puis le A-04. En octobre 1943 le A-06 effectua des essais de remorquage de planeurs, mais il s’avéra que les DFS 230 ou Go 242 remorqués emportaient finalement une charge inférieure à celle d’un unique Ar 232, qui volait beaucoup plus vite, et l’expérience fut rapidement abandonnée. Globalement les essais confirmèrent les qualités de l’avion : avec un équipage normal de 4 hommes, l’Ar 232 avait une charge utile standard de 4 500 kg et pouvait décoller en 200 m au poids total en charge de 16 000 kg. Cette distance pouvait être réduite (on la charge utile accrue) en utilisant des fusées d’appoint au décollage. Avec une vitesse de croisière supérieure de 70 km/h, il surclassait nettement le Ju-53/3m. Tout juste pouvait-on reprocher à l’Arado un manque de puissance en cas de panne d’un moteur, problème qui fut résolu avec l’Ar 232B.
C’est le 3 août 1943 que le premier Ar 323B prit l’air. Contraint à un atterrissage forcé le même jour, au cours de son second vol, il fut détruit à 70% par un incendie après l’atterrissage. Il fut suivi de 9 Ar 232B-0, dont la construction s’acheva en février 1944, mais aucun Ar-232B-1 ne sortit d’usine. En effet le 1er juillet 1944 le Reichsmarshall Göring enterra le programme en raison de son utilisation intensive de matériaux stratégiques, contrairement au Ju 352 qui faisait un usage important d’acier et de bois pour sa construction.