Le jeu est sorti en 1994 aux États-Unis. À l'origine, Capcom prévoyait de ne pas le distribuer en Occident. C'est donc Nintendo qui s'est chargé de la distribution.
Depuis Megaman 2, Capcom organisait au Japon des concours de dessins de robots. Pour Megaman 6, Capcom a exceptionnellement organisé un concours international, en atteste cette annonce parue dans le Consoles + n°18 de mars 1993. L'annonce précisait également les règles du concours :
Les participants gagnant le premier prix (Prix Dr. Wily) avaient l'honneur de voir leur création figurer dans le jeu.
La liste des remerciements dans le générique de fin mentionne les noms de tous les participants ayant remporté le second prix (Prix Dr. Light).
Les vainqueurs des concours de robots perdent tous les droits sur leur création, Capcom pouvant les modifier à sa guise et les réutiliser par la suite.