Cette page n'a ni la prétention ni pour objet de proposer une liste exhaustive des références relatives à la botanique, à la phycologie et à la mycologie, une telle entreprise serait, bien-entendu, sans fin... Son ambition est de présenter une liste d'ouvrages, de publications ou de sites internet reconnus par la communauté scientifique comme incontournables ou majeurs, qu'ils soient généraux ou plus ciblés. Pour les sujets comportant une liste de références trop importante, se reporter aux éventuelles sous-pages plus spécialisées via les liens proposés. Le second objectif de cette page est, pour chaque discipline, d'en présenter les grandes lignes historiques de la littérature ainsi que d'en citer les auteurs ayant le plus de notoriété. Par ailleurs, les espèces fossiles ne sont pas représentées ici. Pour des références se rapportant aux groupes disparus, consulter la page Orientation bibliographique sur l'origine et l'évolution du vivant. Enfin, cette page ne traite que des organismes multicellulaires. Pour des références se rapportant aux algues unicellulaires ou au phytoplancton, consulter la page Orientation bibliographique en microbiologie.
Cabioc'h, J., Floc'h, J.Y., Tonquin (Le), A., Boudouresque (Le), C.A., Meinesz, A., Verlaque, M., 1992. Guide des algues des mer d'Europe. Delachaux et Niestlé (ed.). 231 p. ISBN 2-603-00848-X.
Gorenflot, R., Guern, M., 1989. Organisation et biologie des Thallophytes. Doin (ed.). 235 p. ISBN 2-7040-0597-4.
Reviers (de), B., 2002-2003. Biologie et phylogénie des algues. Tome 1 (2002) et tome 2 (2003), Collection « Belin Sup Sciences », Belin (ed.). ISBN 2-7011-3512-5; ISSN 1158-3762.
Sites internet
Algaebase
Index Nominum Algarum Bibliographia Phycologica Universalis