SYBR Green I - Définition
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Introduction
| SYBR green | |
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| Général | |
| Synonymes | [2-[N-(3-dimethylaminopropyl)- N-propylamino]-4-[2,3- dihydro-3-methyl- (benzo-1,3-thiazol-2-yl)- methylidene]-1- phenyl-quinolinium]+° |
| No CAS | |
| Propriétés chimiques | |
| Formule brute | C32H37N4S |
| Masse molaire | 509,728 ± 0,034 g·mol-1 |
| Propriétés physiques | |
| T° fusion | 262 °C |
| T° d’auto-inflammation | non inflamable (>-6 °C) |
| Précautions | |
| Inhalation | Officiellement aucune (voir Toxicité...) |
| Peau | Officiellement aucune (voir Toxicité...) |
| Yeux | Officiellement aucune (voir Toxicité...) |
| Risque biologique officiel | non dangereux (norme américaine OSHA) |
| Statut officiel des déchets | ni dangereux ni toxique (norme américaine) |
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Le SYBR Green I est un composé organique aromatique de formule chimique C32H37N4S faisant partie des cyanines asymétriques (fluorophores)
Historique
Par souci de clarté, les dates correspondent à la première publication sur le domaine et seul les premiers auteurs sont cités, les références complètes étant dans le chapitre "bibliographie".
- 1975 : Invention d’un test de détection des agents mutagènes et carciogènes par Ames BN (révisé dans une étude de 1983)
- 1992 : Première publication sur les marqueurs fluorescents de l’ADN de la famille des cyanine asymétriques par Rye HS.
- 1993 : Première mention du SYBR green I par Molécular Probes dans le Bioprobes no 18 (numéro en ligne jusqu’au 23, à vérifier)
- 1994 : Premières études de caractérisation du SYBR green I par Jin X.
- 1994 : Premier marquage d’ADN et d’ARN par du SYBR green I sur gel d’électrophorèse de poly-acrylamide par Singer VL.
- 1995 : Premier marquage de produit de RT-PCR sur gel d’électrophorèse d’agarose par Schneeberger CS.
- 1995 : Première révélation de courtes répétition en tandem sur gel de polyacrylamide avec une méthode non radioactive par Morin PA.
- 1995 : Première détection des nucléase en gel sensible avec du SYBR green I par Jin X.
- 1995 : Première utilisation en électrophorèse capillaire par Skeidsvoll J.
- 1997 : Dépôt du brevet américain no 5658751 sur les cyanines asymétriques par Molecular probe. Le SYBR green I semble être le composant no 937.
- 1997 : Première détection des ADN endommagés sur gels d'agarose en champs pulsés par Kiltie AE.
- 1998 : Première quantification de l'activité des nucléases en diffusion radiale par Yasuda T.
- 2000 : Détection de virus en cytométrie de flux avec du SYBR green I par Brussaard CP.
- 2001 : quantification de l’ADN double brin en extraits bruts sur échantillons environnementaux par Bachoon DS.
- 2004 : Publication de la structure et de variabilité du spectre d’émission du SYBR green I par Zipper H.
Propriétés
Utilisation
Le SYBR green I est une molécule pouvant se fixer sur tous les types d’acides nucléique double brins et devenant alors un très bon fluorophore. Il a donc très rapidement servi de méthode alternative au Bromure d'éthidium (BET) ou au marquage radioactif pour un grand nombre de méthodes, dont la détection d’ADN et d’ARN sur gels de polyacrylamide ou d’agarose, classique, en champs pulsé ou « sensible », pré ou post marqués. Il permet également de quantifier les acides nucléiques en solution et, n’interférant que peu avec la réaction en chaîne par polymérase, il est le principal marqueur séquence aspécifique utilisé en PCR en temps réel. Sa très grande sensibilité le rend exploitable en électrophorèse capillaire (détection jusqu’à 80 femtogrammes d’ADN double brin), en cytométrie de flux, pour des puces à ADN, pour de l’imagerie en fluorescence. Il sert également à la quantification d’activités enzymatiques (DNases, télomérases) ou pour celle de l’ADN double brin en milieu défavorable (par la présence d’inhibiteur de fluorescence).
