Introduction
Le groupe EC3.5 rassemble des enzymes appartenant à la famille des hydrolases. Elles ont pour particularité de catalyser des réactions d'hydrolyse dans des molécules possédant un carbone et un azote liés par liaison simple, double ou triple.
À la différence des peptidases (groupe EC3.4), ces enzymes n'interviennent pas sur les liaisons peptidiques mais sur les groupements attachés à un atome d'azote non peptidique ou sur des bases nucléotidiques. Elles jouent un rôle principalement dans la régulation de la synthèse des protéines et dans le métabolisme de certains acides aminés.
On les divise en quatre groupes.
- Les amidases, qui coupent au niveau d'un groupe amide suivant la réaction
R-CO-NH-R' + H2O ⇌ R-COOH + R'-NH2
- Les déiminases qui catalysent les réactions
R-C(=NH)-NH2 + H2O ⇌ R-H + NH2-CO-NH2
ou R-C(=NH)-NH2 + H2O ⇌ R-CH(-NH2)-COOH + NH3
- Les désaminases qui catalysent la réaction
R-C(-NH2)=NH-R' + H2O ⇌ R-CO-NH-R' + NH3
- Les nitrilases qui catalysent la réaction
R-C≡N + 2 H2O ⇌ R-COOH + NH3
Classification des enzymes du groupe EC3.5
EC 3.5.1 : Enzymes spécifiques des amides linéaires (liaison C-N linéaire)
EC 3.5.2 : Enzymes spécifiques des amides cycliques (liaison C-N cyclique)
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- EC 3.5.2.1 : barbiturase
- EC 3.5.2.2 : dihydropyrimidinase
- EC 3.5.2.3 : dihydroorotase
- EC 3.5.2.4 : carboxyméthylhydantoïnase
- EC 3.5.2.5 : allantoïnase
- EC 3.5.2.6 : β-lactamase
- EC 3.5.2.7 : imidazolonepropionase
- EC 3.5.2.8 : supprimée (incluse dans EC 3.5.2.6)
- EC 3.5.2.9 : 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysante)
- EC 3.5.2.10 : créatininase
- EC 3.5.2.11 : -lysine-lactamase
- EC 3.5.2.12 : 6-aminohexanoate-dimère cyclique-hydrolase
- EC 3.5.2.13 : 2,5-dioxopipérazine-hydrolase
- EC 3.5.2.14 : N-méthylhydantoïnase (ATP-hydrolysante)
- EC 3.5.2.15 : acide cyanurique-amidohydrolase
- EC 3.5.2.16 : maléimide-hydrolase
- EC 3.5.2.17 : hydroxyisourate-hydrolase
- EC 3.5.2.18 : énamidase
EC 3.5.3 : Déiminases (enzymes spécifiques des amidines linéaires) (liaison C=N linéaire)
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- EC 3.5.3.1 : arginase
- EC 3.5.3.2 : guanidinoacétase
- EC 3.5.3.3 : créatinase
- EC 3.5.3.4 : allantoïcase
- EC 3.5.3.5 : formiminoaspartate-déiminase
- EC 3.5.3.6 : arginine-déiminase
- EC 3.5.3.7 : guanidinobutyrase
- EC 3.5.3.8 : formimidoylglutamase
- EC 3.5.3.9 : allantoate-déiminase
- EC 3.5.3.10 : -arginase
- EC 3.5.3.11 : agmatinase
- EC 3.5.3.12 : agmatine-déiminase
- EC 3.5.3.13 : formiminoglutamate-déiminase
- EC 3.5.3.14 : amidinoaspartase
- EC 3.5.3.15 : protéine-arginine-déiminase
- EC 3.5.3.16 : méthylguanidinase
- EC 3.5.3.17 : guanidinopropionase
- EC 3.5.3.18 : diméthylargininase
- EC 3.5.3.19 : uréidoglycolate-hydrolase
- EC 3.5.3.20 : diguanidinobutanase
- EC 3.5.3.21 : méthylènediurée-désaminase
- EC 3.5.3.22 : proclavaminate-amidinohydrolase
- EC 3.5.3.23 : N-succinylarginine-dihydrolase
EC 3.5.4 : Enzymes spécifiques des amidines cycliques (liaison C=N cyclique)
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- EC 3.5.4.1 : cytosine-désaminase
- EC 3.5.4.2 : adénine-désaminase
- EC 3.5.4.3 : guanine-désaminase
- EC 3.5.4.4 : adénosine-désaminase
- EC 3.5.4.5 : cytidine-désaminase
- EC 3.5.4.6 : AMP-désaminase
- EC 3.5.4.7 : ADP-désaminase
- EC 3.5.4.8 : aminoimidazolase
- EC 3.5.4.9 : méthényltétrahydrofolate-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.10 : IMP-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.11 : ptérine-désaminase
- EC 3.5.4.12 : dCMP-désaminase
- EC 3.5.4.13 : dCTP-désaminase
- EC 3.5.4.14 : désoxycytidine-désaminase
- EC 3.5.4.15 : guanosine-désaminase
- EC 3.5.4.16 : GTP-cyclohydrolase I
- EC 3.5.4.17 : adénosine-phosphate-désaminase
- EC 3.5.4.18 : ATP-désaminase
- EC 3.5.4.19 : phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.20 : pyrithiamine-désaminase
- EC 3.5.4.21 : créatinine-désaminase
- EC 3.5.4.22 : 1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate-désaminase
- EC 3.5.4.23 : blasticidine S-désaminase
- EC 3.5.4.24 : sépiaptérine-désaminase
- EC 3.5.4.25 : GTP-cyclohydrolase II
- EC 3.5.4.26 : diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-désaminase
- EC 3.5.4.27 : méthényltétrahydrométhanoptérine-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.28 : S-adénosylhomocystéine-désaminase
- EC 3.5.4.29 : GTP-cyclohydrolase IIa
- EC 3.5.4.30 : dCTP-désaminase (formatrice de dUMP)
EC 3.5.5 : Nitrilases (enzymes spécifiques des nitriles) (liaison C≡N)
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- EC 3.5.5.1 : nitrilase
- EC 3.5.5.2 : ricinine-nitrilase
- EC 3.5.5.3 : transférée vers EC 4.3.99.1
- EC 3.5.5.4 : cyanoalanine-nitrilase
- EC 3.5.5.5 : arylacétonitrilase
- EC 3.5.5.6 : bromoxynil-nitrilase
- EC 3.5.5.7 : nitrilase aliphatique
- EC 3.5.5.8 : thiocyanate-hydrolase
EC 3.5.99 : Autres enzymes
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- EC 3.5.99.1 : riboflavinase
- EC 3.5.99.2 : thiaminase
- EC 3.5.99.3 : hydroxydéchloroatrazine-éthylaminohydrolase
- EC 3.5.99.4 : N-isopropylammélide-isopropylaminohydrolase
- EC 3.5.99.5 : 2-aminomuconate-désaminase
- EC 3.5.99.6 : glucosamine-6-phosphate-désaminase
- EC 3.5.99.7 : 1-aminocyclopropane-1-carboxylate-désaminase