Introduite en Europe pour agrémenter les espaces verts de zones urbaines, l'essence est devenue une plante envahissante colonisant les vallées alluviales dans les secteurs humides et perturbées (coupe rase, labour...). L'espèce forme un couvert dense empêchant la croissance d'autres espèces. Cela conduit à une banalisation des milieux et constitue une menace pour la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes.
Un chantier expérimental d'éradication de l'érable negundo en collaboration avec l'INRA et l'Université de Bordeaux 1 a été lancé début 2009.