La mission d'IBEX est de cartographier la frontière délimitant le système solaire, où se rencontre le vent solaire et les rayons galactiques du milieu interstellaire. Ainsi, les mesures d'IBEX vont compléter les données envoyées par les sondes spatiales Voyager 1 et Voyager 2 qui ont respectivement traversé cette frontière en 2004 et 2007.
Cette frontière, l'héliosphère, est importante car si les rayons galactiques n'étaient pas arrêtés dans cette zone, ils rendraient les vols spatiaux habités bien plus dangereux pour l'Homme.
Bien qu'IBEX soit éloigné de la magnétosphère, cette dernière devrait tout de même perturber les observations obligeant ainsi les scientifiques à effectuer diverses corrections sur les données collectées. Mais ces perturbations pourraient indirectement donner des indications sur le comportement de zone de la Terre.