Manfred Eigen (9 mai 1927 à Bochum, Allemagne) est un biophysicien allemand et un ancien directeur de l'Institut Max Planck pour la chimie biophysique. Conjointement avec Ronald George Wreyford Norrish et George Porter, il a reçu le prix Nobel de chimie de 1967.
Après son Abitur en 1944 au Gymnase humaniste de Bochum (aujourd’hui Gymnase am Ostring), Manfred Eigen étudia la physique et la chimie à l'université de Göttingen, où il prépara sa thèse de doctorat sous la direction d’Arnold Eucken. En 1957, il devint directeur de l'actuel Institut Max Planck pour la chimie biophysique.
Conjointement avec Ronald George Wreyford Norrish et George Porter, il obtint le prix Nobel de chimie en 1967 « pour leurs études des réactions chimiques extrêmement rapides, obtenues en perturbant l'équilibre à l'aide de très courtes impulsions d'énergie » (comme les réactions acides-bases).
Il devint membre étranger de la Royal Society en 1973.
En outre le nom de Eigen est lié à la théorie des hypercycles, la liaison cyclique de cycle de réactions comme explication à l'auto-organisation des systèmes prébiotiques, qu'il a décrit en collaboration avec Peter Schuster en 1979.
En 1962, Eigen reçut le prix Otto Hahn de physique-chimie puis en 1994, l'Académie des sciences de Berlin et du Brandebourg lui décerna la médaille Helmholtz. Depuis 2001, Eigen est membre d'honneur de l'Université de la Ruhr à Bochum.