Colonne de Winogradsky - Définition

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Protocole

Pour obtenir un environnement favorable au développement des différentes bactéries il faut essayer de reconstituer un milieu idéal en amenant des composés essentiels à leur croissance. Tout d'abord, il faut ajouter du tampon phosphate à la boue. Ensuite, il faut déposer de la boue dans deux éprouvettes l'une contenant quatre grammes de sulfate de calcium (pour permettre aux bactéries sulfureuses pourpres et vertes de se développer) et l'autre contenant quatre grammes de carbonate de calcium (pour que les bactéries pourpres non sulfureuses puissent croître). Il est nécessaire que la boue atteigne 7,5 cm dans les deux éprouvettes puis il faut mélanger dans un bécher pour homogénéiser. L'expérience se fait de la même façon pour les deux éprouvettes: Dans un premier temps, il faut placer une vingtaine de morceaux de papier filtre au fond de l' éprouvette et verser le mélange, réaliser précédemment, sur une hauteur de 7,5 cm. Dans le bécher contenant la boue restante, ajouter 0,2 g d'hydrogénocarbonate de sodium, 0,1 g de chlorure d'ammonium et le contenu de la gélule de polyvitamines. Mélanger le tout doucement pour éliminer l'air contenu dans le mélange et compléter l'éprouvette avec, jusqu'à ce que la hauteur totale soit de 15 cm. Il est nécessaire de remélanger la colonne pour éliminer totalement l'air et obtenir un milieu en anaérobiose. Ensuite, il faut compléter la colonne avec de la boue neutre jusqu'à 2,5 cm du bord de l'éprouvette et mélanger délicatement pour enlever les bulles d'air. La colonne doit reposer une demi heure. Après le repos, deux phases sont visibles, une solide et une liquide. Cette dernière ne doit pas être supérieur ni inférieur à 1 cm. Il faut donc enlever ou rajouter de l'eau en conséquence. Pour finir, il suffit de recouvrir l'ouverture de la colonne avec du papier céllophane et l'entourer d'un bracelet de caoutchouc pour bien le maintenir. Il faut mettre la colonne près d'une fenêtre ou près de la lampe rouge et la laisser pendant six semaines à température ambiante. Il est possible de répéter l'expérience et de déposer les colonnes à l'obscurité. Cela permet de déterminer les colonies bactériennes phototrophes après comparaison avec les autres colonnes en contact avec la lumière.[citation nécessaire]

Tableau récapitulatif

Genre et ordre d’apparition des bactéries principales

Ressource énergétique

Réaction associée

Type trophique

Condition

environnementale

Clostridium

cellulose

cellulose→glucose

(oxydation)

hétérotrophe

Anaérobie

Desulfovibrio

Hydrogène et sulfate

sulfates→hydrogène sulfuré (H2S)

chimiolithotrophe

Anaérobie aérotolérant

Chlorobium

Hydrogène sulfate et lumière

H2S→soufre insoluble et sulfates

photolithotrophe

Anaérobie

Chromatium

Hydrogène sulfate et lumière

H2S→soufre insoluble et sulfates

photolithotrophe

Anaérobie

Rhodospirillum

Lumière et carbone organique (glucose)

photosyntese

photoorganotrophe

Anaérobie

Beggiatoa

CO2

Oxydation H2S→soufre

chimiolithotrophe

Anaérobie facultatif

Thiobacilius

CO2

Oxydation H2S→soufre

chimiolithotrophe

Aérobie

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