Les modèles d´étude les plus importants sont le maïs et Arabidopsis, mais depuis quelques années des organismes moins conventionnels sont également étudiés, tels que les Cycas ou bien le bryophite, Physcomitrella patens qui vient d´être séquencé. Récemment, l'augmentation importante des génomes séquencés ainsi que des banques d'EST de différents plantes (Oryza sativa, Sorghum bicolor, Carica papaya etc..) permet une analyse bio-informatique des génomes stimulant les recherches en Evo-devo.